2008年5月14日，中国科学院与南京市人民政府在北京南京大饭店签署了全面科技合作协议。中国科学院副院长施尔畏与南京市委书记朱善璐出席了签字仪式，并发表了重要讲话。

施尔畏副院长首先全面回顾了中科院和南京市过去几年中院地合作所取得的进展和成就，并指出应该从南京经济发展的实际需求出发，使中科院更多的科技成果到南京的企业转移转化。与南京市的合作将作为中科院的一种战略行为，使之成为中科院与江苏省合作的重点。施院长还针对与南京市的合作提出了以下三个要求：1、做好现有项目；2、适时启动根据南京市经济发展需求而制定的前瞻部署；3、条件成熟时，在南京建立研发创新平台。

院办公厅，院地合作局，南京分院等有关部门领导同志参加了协议签署仪式。